Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HDAC1Q13547 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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