Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ATRQ13535 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ATRQ13535 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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