Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SMAD4Q13485 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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