Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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TOP3AQ13472 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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