Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RIGQ13278 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
RIGQ13278 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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RIGQ13278 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RIGQ13278 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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