Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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ERCC8Q13216 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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