Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFX1Q12986 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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