Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GRIN2AQ12879 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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GRIN2AQ12879 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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GRIN2AQ12879 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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GRIN2AQ12879 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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GRIN2AQ12879 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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GRIN2AQ12879 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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GRIN2AQ12879 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2AQ12879 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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