Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
BPTFQ12830 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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