Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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