Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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CCDC142Q17RM4 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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