Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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PTPRNQ16849 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRNQ16849 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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