Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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