Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL19A1Q14993 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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