Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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