Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SCARB2Q14108 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SCARB2Q14108 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SCARB2Q14108 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SCARB2Q14108 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SCARB2Q14108 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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