Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CKAP5Q14008 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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