Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL4BQ13620 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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