Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
BNIP3Q12983 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
BNIP3Q12983 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms