Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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PTPREP23469 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPREP23469 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPREP23469 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPREP23469 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PTPREP23469 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PTPREP23469 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PTPREP23469 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPREP23469 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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