Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPRAP18433 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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PTPRAP18433 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PTPRAP18433 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PTPRAP18433 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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