Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD8P13378 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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