Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SOBPA7XYQ1 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms