Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
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RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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RABGEF1Q9UJ41 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1Q9UJ41 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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