Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ME3Q16798 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ME3Q16798 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ME3Q16798 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms