Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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