Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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ZNF239Q16600 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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ZNF239Q16600 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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ZNF239Q16600 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZNF239Q16600 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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