Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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TTF1Q15361 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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TTF1Q15361 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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TTF1Q15361 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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TTF1Q15361 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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TTF1Q15361 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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