Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PCOLCEQ15113 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms