Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms