Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms