Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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DDX39BQ13838 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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DDX39BQ13838 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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