Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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