Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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