Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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