Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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