Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CACNB1Q02641 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms