Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPRMP28827 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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