Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MAP3K4Q9Y6R4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms