Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms