Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZMYND8Q9ULU4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms