Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACL1Q9UJ83 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACL1Q9UJ83 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACL1Q9UJ83 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACL1Q9UJ83 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACL1Q9UJ83 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACL1Q9UJ83 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms