Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms