Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5BQ9UGL1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms