Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms