Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP35Q9P2H5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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