Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP36Q9P275 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms