Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DLL3Q9NYJ7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DLL3Q9NYJ7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms