Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG3Q9NT62 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG3Q9NT62 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms