Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms